Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh15P33146 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh15P33146 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms