Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc11P31313 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms