Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msr1P30204 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msr1P30204 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms