Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casp1P29452 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casp1P29452 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms