Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RxraP28700 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RxraP28700 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RxraP28700 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RxraP28700 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RxraP28700 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RxraP28700 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RxraP28700 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RxraP28700 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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