Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Hoxd10P28359 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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