Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd9P28357 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd9P28357 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms