Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Etv4P28322 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Etv4P28322 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms