Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb3P28231 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb3P28231 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms