Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PdgfraP26618 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PdgfraP26618 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms