Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou2f1P25425 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou2f1P25425 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms