Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk11bP24788 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk11bP24788 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms