Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms