Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd12P23812 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms