Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkchP23298 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkchP23298 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkchP23298 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkchP23298 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkchP23298 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkchP23298 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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