Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clk1P22518 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clk1P22518 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clk1P22518 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms