Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f1P21952 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms