Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmnb2P21619 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmnb2P21619 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmnb2P21619 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmnb2P21619 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms