Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb9P20615 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms