Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP20293 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP20293 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP20293 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TP20293 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TP20293 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TP20293 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms