Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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