Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P20040 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P20040 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P20040 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P20040 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P20040 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P20040 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms