Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl13aP19253 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms