Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NefhP19246 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NefhP19246 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NefhP19246 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NefhP19246 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NefhP19246 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NefhP19246 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NefhP19246 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NefhP19246 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NefhP19246 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NefhP19246 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NefhP19246 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NefhP19246 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NefhP19246 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NefhP19246 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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