Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnaP17918 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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PcnaP17918 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PcnaP17918 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PcnaP17918 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PcnaP17918 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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