Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra6P16305 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms