Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irf1P15314 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms