Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmnb1P14733 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms