Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd5P13379 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms