Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl1P12850 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl1P12850 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms