Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd1d1P11609 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms