Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fv4P11370 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fv4P11370 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms