Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp28P10078 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp28P10078 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms