Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igsf6P0C6B7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms