Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc9P09633 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms