Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa9P09631 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms