Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtaP09225 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtaP09225 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtaP09225 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtaP09225 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LtaP09225 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtaP09225 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtaP09225 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtaP09225 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms