Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa6P09092 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hoxa6P09092 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hoxa6P09092 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa6P09092 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms