Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApoeP08226 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApoeP08226 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms