Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spta1P08032 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spta1P08032 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms