Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms