Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06321 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06321 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06321 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P06321 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06321 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P06321 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06321 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06321 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06321 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06321 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms