Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hbb-bh1P04444 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms