Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04224 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04224 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04224 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04224 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04224 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04224 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04224 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04224 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04224 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04224 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04224 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms