Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04212 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04212 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04212 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04212 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04212 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms