Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GzmbP04187 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GzmbP04187 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms