Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa3P02831 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa3P02831 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms