Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxa7P02830 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa7P02830 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms