Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-AaP01910 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms