Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01822 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01822 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01822 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01822 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01822 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01822 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms